O Programa de Pós-Graduação em Ciêncais Ambientais da UNIFAP (PPGCA) foi criado em 2017 e é o primeiro PPG em na área de ciências ambientais no Amapá. O PPGCA possui uma área de concentração (Ciências Ambientais da Amazônia) e duas linhas de pesquisa (Gestão, Tecnologia e Inovação Ambiental; e Recursos Naturais e Sistemas Ecológicos). O PPGCA tem como objetivo ser um agente transformador da realidade socioambiental no Amapá a partir da formação de profissionais qualificados para atuar em uma ampla variedade de áreas do conhecimento, destacando-se a promoção do uso racional dos recursos naturais e a sustentabilidade ambiental frente aos desafios do desenvolvimento socioeconômico. Trata-se de um programa de caráter interdisciplinar na qual diversas áreas da ciência se integrariam para gerar novos conhecimentos utilizando a temática socioambiental com foco em problemas ambientais relevantes. As pesquisas do PPGCA abrangem áreas como gestão e sustentabilidade ambiental, problemas e conflitos socioambientais, ecologia e biodiversidade tropical, geração, desenvolvimento e inovação de tecnologias apropriadas para o desenvolvimento sustentável, estudo e análises de processos ambientais (saneamento ambiental, energias renováveis, biotecnologia, nanotecnologia, avaliação de impactos ambientais, gestão de fauna e flora, agricultura, saúde ambiental, populações humanas, clima urbano, poluição e ecotoxicologia, etc). Assim sendo, o PPGCA objetiva melhorar a qualidade de vida local através de processos educativos de alto nível com a promoção de melhor relação entre as esferas social, ambiental e econômica.